PKBM Perdana Jaya memiliki sekretariat di Jl. Rahwono Aji nomor 47 Sukorejo, Gondanglegi dengan fasilitas berupa dua ruang belajar yang nyaman, ruang kepala sekolah, ruang guru, kamar mandi, mushola, lima belas buah chrome book, enam buah kaptop, dua buah LCD proyektor, satu perangkat pengeras suara, dan kolam lele beserta peralatan budidaya ikan lele sebagai sarana belajar keterampilan budidaya dan wirausaha ikan lele.